高倍顯微鏡是光學顯微鏡的一種，而非電子顯微鏡。
高倍顯微鏡屬于光學顯微鏡的范疇，其放大倍數和分辨率雖然高于普通光學顯微鏡，但遠不及電子顯微鏡。高倍顯微鏡利用可見光作為光源，通過光學鏡片來偏轉光子的傳播方向或聚焦光束，以實現對微小物體的高倍放大。
相比之下，電子顯微鏡則使用電子束作為“光源”，通過電磁場來偏轉或聚焦電子束，從而獲得比光學顯微鏡更高的分辨率和放大倍數。電子顯微鏡能夠觀察到細胞器的精細結構，甚至可以看到病毒這種最小生物的結構，更甚至可以看到大分子，如蛋白質。
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