分子蒸餾原理是基于不同物質的分子在高真空條件下，其平均自由程差異實現分離的液-液分離技術。
分子蒸餾是一種在高真空下進行的蒸餾方法。在這種條件下，蒸氣分子的平均自由程大于蒸發表面與冷凝表面之間的距離，從而可以利用料液中各組分蒸發速率的差異對液體混合物進行分離。這種技術通過減薄液層厚度及強化液層的流動來控制分子從液相主體向蒸發表面的擴散速度。